办理设施农用地手续，首先需要到自然资源部门查询一下选址是不是涉及基本农田，基本农田不允许建设设施农用地，不涉及基本农田的才可以申请办理设施农用地手续。设施农用地使用前，生产经营者拟定建设方案，内容应包括项目名称、建设地点、设施类型和用途、数量、标准和用地规模等，并于村集体经济组织和乡镇政府协商土地使用年限、土地复垦要求及时限、土地交还和违约责任等，协商一致后，将建设方案和土地使用条件通过乡镇、村政务公开等形式向社会公布，公告期不少于10天，公告期满无异议的，乡镇政府、村委会和经营者签订用地协议。涉及土地流转的，经营者应依法与承包农户签订流转合同。协议签订后，乡镇政府需及时将设施农用地备案申请，用地协议，建设方案、复垦协议等材料分别报国土资源和农业部门备案，申报材料不符合设施农用地有关规定的不得建设。

      同时，项目开工前，经营者需足额缴存土地复垦费用，生产结束后，按规定进行土地复垦，占用耕地的应复垦为耕地，保证质量不降低